Soutenance Thèse

Il est temps pour moi de conclure ces trois années de recherche sur les tiques et de vous inviter à ma soutenance de thèse. Cette soutenance aura lieu le jeudi 6 décembre à Nantes, sur le campus vétérinaire d’Oniris (La Chantrerie) à 13h15 dans l’amphi Pierre Cuq (premier bâtiment à gauche après la Loge). S’en suivra un pot pour vous remercier de votre présence. Dans un deuxième temps, nous pourrions nous retrouver dans le centre de Nantes autour d’un verre à une adresse qui vous sera communiquée très prochainement.

La soutenance se déroulera en Français avec un support en Anglais.

Sujet de thèse et Jury

Titre : Diversité génomique, évolution et adaptation de la tique Ixodes ricinus.

Résumé : Les tiques sont des acariens hématophages vecteurs de nombreux micro-organismes dont certains sont responsables de maladies humaines ou animales (Borréliose de Lyme par exemple). La tique Ixodes ricinus, est largement distribuée en Europe où elle représente le principal vecteur de l’agent responsable de la maladie de Lyme. Trois volets ont été abordés au cours de cette thèse, en réalisant pour chaque point des séquençages à haut-débit de transcriptomes. Dans le premier volet, un catalogue de transcrits a été reconstruit et annoté à partir d’individus provenant de différentes conditions physiologiques (stade de développement, état de gorgement, sexe). Une analyse d’expression différentielle a permis de déterminer quels gènes sont exprimés plus spécifiquement lors du gorgement (protéines cuticulaires notamment, mais également métalloprotéases, etc.). Dans le deuxième volet, la structure génétique d’I. ricinus a été explorée à partir de douze populations européennes. Mes résultats montrent pour la première fois un signal clair de structuration géographique, et d’isolation par la distance, à l’échelle de l’Europe. Dans le troisième volet, j’ai employé une approche phylogénomique sur le groupe des tiques dures : pour cela, j’ai reconstruit les transcriptomes de 27 espèces de tiques (dont neuf espèces séquencées pour ce projet) permettant de proposer un arbre phylogénétique très robuste pour ce groupe.

Mots clés : Transcriptome, Ixodes ricinus, RNA-seq, Analyse d’expression différentielle, Génomique des populations, Phylogénomique.

Directeur de thèse :
  • Dr Claude Rispe, Chargé de Recherche, INRA (Bioepar – Nantes, France)
Rapporteurs :
  • Dr Gael J. Kergoat, Directeur de Recherche, INRA (CBGP – Montpellier, France)
  • Dr Denis Baurain, Associate Professor, Université de Liège (Belgique)
Examinateurs :
  • Dr Karen D. McCoy, Directrice de Recherche, CNRS (Mivegec – Montpellier, France)
  • Dr Monique Zagorec, Directrice de Recherche, INRA (SECALIM – Nantes, France)

Informations pratiques

Adresse:

Amphithéâtre Pierre Cuq, Hall d’honneur, Oniris – La Chantrerie, 101 Route de Gachet, 44300 Nantes

Accès
  • Prévoir son voyage avec la Tan : https://plan-tan.fr/
  • Bus 75 arrêt “Ecole Vétérinaire”
  • Bus C6 terminus “Chantrerie” + 15 minutes de marche
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Soutenance-Infos

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Aeroport: 47.157849, -1.601000
Amphithéâtre Pierre Cuq: 47.289271, -1.523774
Gare: 47.217626, -1.541862
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Nantes Pays-de-la-Loire, France
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Amphithéâtre Pierre Cuq, Hall d'honneur, Oniris - La Chantrerie, 101 Route de Gachet, 44300 Nantes
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